2. В правой части окна игры висит "Scoreboard" (см. скриншот), назначение которого лично мне не совсем понятно. Предлагаю либо убрать его, либо сделать отключаемым вводом команды.

3. В списке игроков по нажатию Tab некорректно отображаются ники игроков. (см. скриншот)

1. Приват территории. Понимаю, что карта не резиновая, но всё-таки допустимый размер приватов у начальных групп слишком маленький. Тем более, в новых версиях высота мира значительно увеличилась. Потому предлагаю следующее:
   Junior: 3×3072
   Member: 5×102400
   Advanced Member: 10×51200
   Advanced Unlimited Member: без ограничений
   (первое число — количество допустимых территорий)
2. Количество варпов (приватный/публичный). В этом пункте, кстати, на странице ошибка, ведь личный и приватный — одно и то же :-? 
   Junior: 1/0
   Member: 5/3
   Advanced Member: 5/8
   Advanced Unlimited Member: без ограничений
3. /hat — надеть на голову любой выбранный предмет. А здесь ошибка в команде /help в игре, ведь "крутой головной убор" — это на усмотрение игрока.
   Никаких особых привилегий эта возможность не даёт, поэтому можно оставить всем, начиная с Member.
4. /ignore — игнорировать игрока.
   Эта возможность может быть полезна всем игрокам без исключения, поэтому предлагаю сделать её общедоступной.
5. /clearinventory — очистка ивентаря.
   Сомневаюсь, что в выживании её использование вообще уместно, но предлагаю оставить для Advanced Member и выше.
6. /feed — избавиться от голода.
   Эта возможность уже немного нарушает баланс игры в режиме выживания, но не так, как /heal (см. ниже), поэтому предлагаю также оставить для Advanced Member и выше.
7. /workbench — персональный верстак.
   Дерево для крафта верстака отнюдь не является сложнодобываемым ресурсом, поэтому эта команда лишь упрощает крафт. Предлагаю оставить для всех групп от Member и выше.
8. /kit — получить набор ресурсов.
   Здесь предлагаю для каждой группы (от Member и выше) использовать свой набор ресурсов. Материал для наборов стоит выбирать таким образом, чтобы не нарушать баланс. То есть по задумке у игроков конкретной группы эти ресурсы и так есть, но удобнее ввести команду и получить набор, не потратив ничего. Для Member можно использовать железо для брони и инструментов, для Advanced Member — алмазы, ну а для Advanced Unlimited Member — незерит.
9. /me — описывает действие от лица игрока в чате (например, /me кушает макароны).
   Команда не даёт каких-то преимуществ, поэтому можно сделать общедоступной.
10. Дополнительные флаги для территорий.
    В идеале, для каждой группы сделать разные возможные флаги. Но дабы не усложнять, предлагаю оставить возможность для Advanced Member и выше.
11. /back — вернуться на место смерти (либо место до телепортации на варп).
    Здесь всё хорошо, для Advanced Member и выше.
12. /heal — пополнить здоровье.
    Эта возможность более имбалансная, чем /feed, так как восстанавливает всё здороье разом. Предлагаю оставить только для Advanced Unlimited Member.
13. /nick — сменить ник.
    Если это не происходит слишком часто, то ничего плохого в этой возможности не вижу. Можно сделать для Member и выше и установить интервал для смены никнеймов. Скажем, месяц для Member и неделя для Advanced Member и выше.
    Хотя в справке о команде (/help) показывает возможность присвоить текст вместо ника любого игрока (видимо, индивидуально). Пока не смог проверить, работает ли это таким образом.
14. /repair all — починить все вещи в инвентаре.
    Таким образом эта команда, к сожалению, не работает. Можно починить только предмет в руке командой /repair. В принципе, большего и не нужно. Предлагаю оставить как есть, для Advanced Member и выше. Однако, это даёт сильное преимущество.
15. /fly — полёт.
    Также довольно серьёзное преимущество. В идеале — ограничить использование по времени. Например, 5 минут для Advanced Member и 15 — для Advanced Unlimited Member.
16. /enderchest — персональный сундук Эндера.
    У меня эта команда не работает. Но в принципе, можно оставить так же для Advanced Member и выше.
17. /seen player — посмотреть, когда игрок был онлайн (а также UUID).
    Не вижу в этой команде ничего плохого, можно сделать доступной для Member и выше.
18. /anvil — персональная наковальня.
    С командой /repair её использование не очень актуально, но можно сделать для Member и выше. Всё-таки железо для крафта наковальни у таких игроков всё равно уже есть.
19. /enchant — зачаровывание.
    Кажется, сейчас мне доступна только чара эффективности. Эту команду, конечно, стоит переработать. Опять же, в идеале — для разных групп (Advanced Member и Advanced Unlimited Member) стоит использовать разные чары и уровни, но можно сделать общий набор и ограничить его по уровням.
20. /getpos — показать вашу позицию.
    Не понимаю, почему она доступна только для Advanced Unlimited Member, ведь то же самое можно увидеть, нажав F3 :-D Думаю, стоит сделать общедоступной.
    
    Далее идут команды, не описанные на странице overminers.ru/help/:
21. /compass — указывает направление взгляда игрока.
    Предлагаю оставить для Member и выше.
22. /firework — позволяет изменить стак фейерверков.
    Честно говоря, ещё не проверял её работу, но думаю, стоит оставить для Member и выше.
23. /god — режим бессмертия для игрока.
    Самая имбалансная возможность. Считаю, что стоит оставить только для модераторов и администраторов. У нас ведь всё-таки выживание ;-) 
24. /near — список игроков рядом.
    Предлагаю оставить для Advanced Member и выше.
25. /whois — показывает информацию об игроке (здоровье, опыт, статус, местоположение).
    Всё-таки некоторая информация здесь лишняя. Эту команду стоит либо совсем отключить для игроков, либо оставить для Advanced Member и выше.
26. /breedlimit — показывает лимит на указанного моба в чанке.
    Может быть полезной, предлагаю сделать доступной для Member и выше.
27. //expand — изменение высоты/ширины выбранного блока по направлению взгляда. Думаю, для Junior в ней нет особой необходимости.
28. /tpa — запросить телепорт к игроку;
    /tpahere — запросить игрока телепортироваться к вам;
    /tpaccept — разрешить запрос;
    /tpdeny — отклонить запрос.
    Удобно, но может быть не очень честно. Однако, многие привыкли к этой команде. Предлагаю оставить для Member и выше.
29. /worth — стоимость предмета;
    /balance — баланс игрока;
    /pay — передать деньги игроку;
    /sell продать предмет игроку.
    Система интересная, но не очень продуманная. Например, откуда у игроков внутреигровая валюта?
    Было бы прекрасно сделать возможность, как во многих онлайн-играх: каждый день при входе на сервер получать некоторое(небольшое) количество денег. За два дня подряд — побольше денег, три — ещё больше, и так далее, но в разумных пределах.

Кажется, расписал всё, что мог. Ну, в качестве приятного дополнения было бы неплохо отключить рекламные объявления в чате для групп Member и выше.

На этом пока всё. Благодарю за уделённое внимание прочтению этого длиннопоста! :-)